Как рассчитать налог на прибыль при оптовой и розничной торговле?

Добрый день. Я по образованию не бухгалтер, но так сложилось что пришлось к этому приложить свои руки.
Организация. Основной вид деят-ти - производство электромонтажных работ. 43.21
Дополнительные: 46.69.5
Торговля оптовая производственным электротехническим оборудованием, машинами, аппаратурой и материалами
46.69.9
Торговля оптовая прочими машинами, приборами, аппаратурой и оборудованием общепромышленного и специального назначения
47.54
Торговля розничная бытовыми электротоварами в специализированных магазинах
ну и прочее.

За 2 квартал был заключен один договор поставки (различные щиты управления) на сумму 1 370 000 руб. 
Покупатель перечислил нам аванс. Выставила с.ф. на аванс.
Закупили для этой поставки уже готовые 6 щитов и еще один сами собирали уже из готовых закупленных товаров. Все это товары я поставила на 41 счет. 
Отгрузка пройдет только 3 кварталом.
У меня почему то в декларацию по налогу на прибыль не встают в расходы по приобретенному для перепродажи товар, а встают только внереализационные расходы (услуги банка).
Мне кажется что я вообще учетную политику в 1с 8.3 неверно настроила. Сколько бы не читала, все равно все это для меня темный лес. помогите пожалуйста.

Способ оценки МПЗ - по средней. Основной учет затрат - 26. Галочки стоят на выпуске продукции и выполнении работ, без учета выручки. Метод директ-костинг.